Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRMS1LQ5PSV4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms