Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms