Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms