Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms