Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIK1Q3SY52 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIK1Q3SY52 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms