Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP24-1Q3LI83 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms