Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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