Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GEN1Q17RS7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GEN1Q17RS7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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