Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms