Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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