Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC23BQ15437 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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