Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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