Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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