Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms