Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNB1Q14721 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNB1Q14721 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms