Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC1Q13547 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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