Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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TUBB3Q13509 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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