Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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