Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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