Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 YPL044CYPL044C 549 nt2.04□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 CTF4YPR135W 2784 nt2.04□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 TRL1YJL087C 2484 nt2.03□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 SKP2YNL311C 2292 nt2.03□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 CTR9YOL145C 3234 nt2.03□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 MSB1YOR188W 3414 nt2.03□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 STH1YIL126W 4080 nt2.02□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 SAP185YJL098W 3177 nt2.02□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 APL5YPL195W 2799 nt2.01□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 AGC1YPR021C 2709 nt2.01□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 MSH5YDL154W 2706 nt2□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 ALK1YGL021W 2283 nt2□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 FRK1YPL141C 2598 nt2□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 PKH2YOL100W 3246 nt2□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 RGA1YOR127W 3024 nt1.99□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.99□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 RPS30BYOR182C 192 nt1.99□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 YBR099CYBR099C 384 nt1.99□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 SYH1YPL105C 2550 nt1.99□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 PMP2YEL017C-A 132 nt1.98□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 RTT101YJL047C 2529 nt1.97□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 TFC3YAL001C 3483 nt1.97□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.97□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.97□□□□□ -2.09
TRM13Q12383 SPP41YDR464W 4308 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YDR521WYDR521W 336 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 CMC4YMR194C-B 222 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 CHC1YGL206C 4962 nt1.96□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 IFH1YLR223C 3258 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 TOR2YKL203C 7425 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 SLI15YBR156C 2097 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YOR019WYOR019W 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 PRP5YBR237W 2550 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 PAA1YDR071C 576 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 ATG11YPR049C 3537 nt1.95□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 TTI1YKL033W 3117 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YPR097WYPR097W 3222 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 COG4YPR105C 2586 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 RPL37BYDR500C 267 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YHR217CYHR217C 462 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 APL1YJR005W 2103 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 SCP160YJL080C 3669 nt1.94□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 UBP1YDL122W 2430 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 RTT107YHR154W 3213 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 BRE1YDL074C 2103 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 UFD4YKL010C 4452 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 COX12YLR038C 252 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 DGR1YNL130C-A 147 nt1.93□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 IST2YBR086C 2841 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YBR206WYBR206W 324 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 FKS1YLR342W 5631 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 KOG1YHR186C 4674 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 UBP2YOR124C 3819 nt1.92□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YNL211CYNL211C 261 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 DNA2YHR164C 4569 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.91□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 ADR1YDR216W 3972 nt1.9□□□□□ -2.1
TRM13Q12383 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 GCN2YDR283C 4980 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 HER1YOR227W 3741 nt1.9□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 SEY1YOR165W 2331 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 PDR3YBL005W 2931 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 snR61snR61 90 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YNL144CYNL144C 2223 nt1.89□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 UTP8YGR128C 2142 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 OST4YDL232W 111 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YLR282CYLR282C 342 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 CHS6YJL099W 2241 nt1.88□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.87□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 SOM1YEL059C-A 225 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 CDC31YOR257W 486 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 SLN1YIL147C 3663 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 SFB2YNL049C 2631 nt1.86□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YDL118WYDL118W 381 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 MBB1YJL199C 327 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YDL206WYDL206W 2289 nt1.85□□□□□ -2.11
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