Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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