Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms