Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms