Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms