Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FMODQ06828 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FMODQ06828 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FMODQ06828 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms