Protein–RNA interactions for Protein: Q06686

CTR3, Copper transport protein CTR3, yeastyeast

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTR3Q06686 YOR282WYOR282W 321 nt0.65□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 CUL3YGR003W 2235 nt0.65□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 GEA2YEL022W 4380 nt0.64□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 RPS24BYIL069C 408 nt0.64□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.64□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 ANS1YHR126C 480 nt0.63□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YKL063CYKL063C 504 nt0.63□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YPL205CYPL205C 345 nt0.63□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 BFR2YDR299W 1605 nt0.63□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 PMP1YCR024C-A 123 nt0.62□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 NHP2YDL208W 471 nt0.62□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YDR521WYDR521W 336 nt0.62□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 MAM33YIL070C 801 nt0.62□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YLR202CYLR202C 327 nt0.62□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 NOP9YJL010C 2001 nt0.62□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YJR011CYJR011C 786 nt0.61□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 RPL38YLR325C 237 nt0.61□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YLL007CYLL007C 1998 nt0.6□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YBR064WYBR064W 429 nt0.6□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YCK3YER123W 1575 nt0.59□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.59□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.59□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YPL185WYPL185W 396 nt0.59□□□□□ -2.31
CTR3Q06686 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.58□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.58□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YBR206WYBR206W 324 nt0.58□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 PTP2YOR208W 2253 nt0.58□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 ECM12YHR021W-A 456 nt0.57□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.57□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YDR426CYDR426C 378 nt0.56□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 CHS6YJL099W 2241 nt0.55□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YLR434CYLR434C 384 nt0.55□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 CMC4YMR194C-B 222 nt0.55□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YNL324WYNL324W 396 nt0.55□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YPL044CYPL044C 549 nt0.55□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YDR344CYDR344C 444 nt0.54□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 OLI1Q0130 231 nt0.54□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YJR157WYJR157W 363 nt0.54□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 LTE1YAL024C 4308 nt0.54□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 AGA2YGL032C 264 nt0.53□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 PCC1YKR095W-A 267 nt0.53□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.53□□□□□ -2.32
CTR3Q06686 MCM10YIL150C 1716 nt0.52□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 NPR2YEL062W 1848 nt0.52□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.52□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 ASE1YOR058C 2658 nt0.51□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YOR053WYOR053W 342 nt0.51□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YBR285WYBR285W 435 nt0.51□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YSP1YHR155W 3687 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 BSC3YLR465C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 PRM3YPL192C 402 nt0.5□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 PAM16YJL104W 450 nt0.49□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YML002WYML002W 2214 nt0.48□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YOR218CYOR218C 420 nt0.48□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 PAA1YDR071C 576 nt0.47□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YER079WYER079W 633 nt0.47□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.47□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 Q0144Q0144 330 nt0.47□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.47□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 SPO21YOL091W 1830 nt0.47□□□□□ -2.33
CTR3Q06686 HMRA2YCR096C 360 nt0.46□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 VPS20YMR077C 666 nt0.46□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 FYV10YIL097W 1551 nt0.45□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 BEM3YPL115C 3387 nt0.45□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YAR029WYAR029W 225 nt0.45□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YLR334CYLR334C 381 nt0.44□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YOR121CYOR121C 306 nt0.44□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 UBP3YER151C 2739 nt0.43□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 RPL26BYGR034W 384 nt0.43□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.43□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YAR053WYAR053W 297 nt0.43□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.43□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 HAL9YOL089C 3093 nt0.43□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 CSN9YDR179C 489 nt0.42□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.42□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.42□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 LEE1YPL054W 906 nt0.42□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 OST1YJL002C 1431 nt0.41□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YHR138CYHR138C 345 nt0.41□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YNL211CYNL211C 261 nt0.41□□□□□ -2.34
CTR3Q06686 YJL120WYJL120W 324 nt0.4□□□□□ -2.35
CTR3Q06686 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.4□□□□□ -2.35
CTR3Q06686 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.4□□□□□ -2.35
CTR3Q06686 BIL1YOR304C-A 231 nt0.4□□□□□ -2.35
CTR3Q06686 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 218.5 ms