Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms