Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC25A11Q02978 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms