Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms