Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms