Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms