Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTUD4Q01804 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms