Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms