Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms