Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA4Q00056 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms