Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms