Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP25P60880 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms