Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTBP60709 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTBP60709 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTBP60709 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms