Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEMP55040 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEMP55040 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEMP55040 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEMP55040 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEMP55040 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEMP55040 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEMP55040 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEMP55040 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEMP55040 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEMP55040 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEMP55040 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEMP55040 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEMP55040 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEMP55040 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEMP55040 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEMP55040 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms