Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB3P54284 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms