Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 COX5BYIL111W 456 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNT2P53127 IRC16YPR038W 360 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 POP7YBR167C 423 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 ORC3YLL004W 1851 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 snR9snR9 187 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 OLI1Q0130 231 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YMR254CYMR254C 309 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 MYO1YHR023W 5787 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNT2P53127 EFR3YMR212C 2349 nt-0.14□□□□□ -2.43
SNT2P53127 RCO1YMR075W 2055 nt-0.14□□□□□ -2.43
SNT2P53127 RPL35AYDL191W 363 nt-0.14□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YPT6YLR262C 648 nt-0.14□□□□□ -2.43
SNT2P53127 RPB10YOR210W 213 nt-0.14□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNT2P53127 PRP21YJL203W 843 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YOL160WYOL160W 342 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YPR039WYPR039W 336 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNT2P53127 MRPL32YCR003W 552 nt-0.16□□□□□ -2.44
SNT2P53127 LEE1YPL054W 906 nt-0.16□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YDR029WYDR029W 315 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YGL230CYGL230C 444 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YGL239CYGL239C 315 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YLR198CYLR198C 360 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNT2P53127 SCEIQ0160 708 nt-0.18□□□□□ -2.44
SNT2P53127 RPS27AYKL156W 249 nt-0.18□□□□□ -2.44
SNT2P53127 AFB1YLR040C 675 nt-0.18□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YPL185WYPL185W 396 nt-0.18□□□□□ -2.44
SNT2P53127 OST4YDL232W 111 nt-0.19□□□□□ -2.44
SNT2P53127 ASE1YOR058C 2658 nt-0.19□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YAP6YDR259C 1152 nt-0.2□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.2□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT2P53127 UBS1YBR165W 834 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT2P53127 PTP2YOR208W 2253 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT2P53127 snR72snR72 98 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT2P53127 YER135CYER135C 393 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT2P53127 RPS26AYGL189C 360 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNT2P53127 PAA1YDR071C 576 nt-0.22□□□□□ -2.45
SNT2P53127 MND1YGL183C 660 nt-0.22□□□□□ -2.45
SNT2P53127 MAM33YIL070C 801 nt-0.22□□□□□ -2.45
SNT2P53127 NFU1YKL040C 771 nt-0.22□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YKL136WYKL136W 399 nt-0.22□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YDL187CYDL187C 330 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNT2P53127 PBI2YNL015W 228 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YBR206WYBR206W 324 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNT2P53127 HUR1YGL168W 333 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YPL261CYPL261C 309 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YDR210WYDR210W 228 nt-0.25□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.25□□□□□ -2.45
SNT2P53127 APQ13YJL075C 417 nt-0.25□□□□□ -2.45
SNT2P53127 SNU56YDR240C 1479 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNT2P53127 SPO21YOL091W 1830 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YKL202WYKL202W 582 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNT2P53127 ECM9YKR004C 1134 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YOL029CYOL029C 606 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNT2P53127 DCP1YOL149W 696 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YIR044CYIR044C 186 nt-0.27□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YML108WYML108W 318 nt-0.27□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YNL146WYNL146W 303 nt-0.27□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YNL211CYNL211C 261 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT2P53127 snR51snR51 107 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNT2P53127 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.29□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YGR025WYGR025W 303 nt-0.29□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YJR087WYJR087W 351 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YOR345CYOR345C 351 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YJR011CYJR011C 786 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YLR171WYLR171W 390 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YPL182CYPL182C 384 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.31□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YCR001WYCR001W 315 nt-0.32□□□□□ -2.46
SNT2P53127 MRPS8YMR158W 468 nt-0.32□□□□□ -2.46
SNT2P53127 IPP1YBR011C 864 nt-0.32□□□□□ -2.46
SNT2P53127 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.32□□□□□ -2.46
SNT2P53127 TIM13YGR181W 318 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YIL029CYIL029C 429 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT2P53127 NIP1YMR309C 2439 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNT2P53127 SOV1YMR066W 2697 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YKU70YMR284W 1809 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT2P53127 COY1YKL179C 2040 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT2P53127 snR8snR8 190 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNT2P53127 YCR100CYCR100C 951 nt-0.35□□□□□ -2.47
SNT2P53127 SDH7YDR511W 402 nt-0.35□□□□□ -2.47
SNT2P53127 YKL044WYKL044W 321 nt-0.35□□□□□ -2.47
SNT2P53127 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.36□□□□□ -2.47
SNT2P53127 snR128snR128 126 nt-0.36□□□□□ -2.47
SNT2P53127 SBH2YER019C-A 267 nt-0.37□□□□□ -2.47
SNT2P53127 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.37□□□□□ -2.47
SNT2P53127 YPL225WYPL225W 441 nt-0.37□□□□□ -2.47
SNT2P53127 RPS20YHL015W 366 nt-0.38□□□□□ -2.47
SNT2P53127 ATG31YDR022C 591 nt-0.4□□□□□ -2.47
SNT2P53127 YHL041WYHL041W 450 nt-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 175.6 ms