Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms