Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LUMP51884 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LUMP51884 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LUMP51884 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LUMP51884 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LUMP51884 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms