Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP11P51784 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP11P51784 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP11P51784 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP11P51784 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP11P51784 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP11P51784 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP11P51784 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms