Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms