Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFBP49765 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms