Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NESP48681 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NESP48681 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NESP48681 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NESP48681 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NESP48681 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NESP48681 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NESP48681 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NESP48681 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NESP48681 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NESP48681 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NESP48681 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NESP48681 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NESP48681 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NESP48681 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NESP48681 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NESP48681 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NESP48681 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NESP48681 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NESP48681 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NESP48681 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NESP48681 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NESP48681 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NESP48681 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NESP48681 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NESP48681 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NESP48681 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NESP48681 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NESP48681 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NESP48681 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms