Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPHP41219 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPHP41219 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms