Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 PKH2YOL100W 3246 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YJR157WYJR157W 363 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT7P40501 RIM20YOR275C 1986 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT7P40501 IRC23YOR044W 474 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT7P40501 WAR1YML076C 2835 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT7P40501 KAP120YPL125W 3099 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT7P40501 CUL3YGR003W 2235 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT7P40501 UTP20YBL004W 7482 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT7P40501 SWF1YDR126W 1011 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YGR042WYGR042W 816 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT7P40501 INA22YIR024C 651 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YOR053WYOR053W 342 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YPR117WYPR117W 7470 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YER079WYER079W 633 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT7P40501 RPS20YHL015W 366 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT7P40501 VPS20YMR077C 666 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT7P40501 MAM33YIL070C 801 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT7P40501 BSC3YLR465C 309 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT7P40501 YBR285WYBR285W 435 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT7P40501 PAU24YBR301W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT7P40501 NIP100YPL174C 2607 nt0.78□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YHL042WYHL042W 453 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT7P40501 PCC1YKR095W-A 267 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT7P40501 PTP2YOR208W 2253 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YLL007CYLL007C 1998 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT7P40501 OST1YJL002C 1431 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YDR426CYDR426C 378 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YHR138CYHR138C 345 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YDL196WYDL196W 330 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT7P40501 ISD11YER048W-A 285 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YJR011CYJR011C 786 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT7P40501 PAU12YGR294W 363 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YOR121CYOR121C 306 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT7P40501 LEE1YPL054W 906 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT7P40501 YDR521WYDR521W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT7P40501 ALG13YGL047W 609 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT7P40501 DBP6YNR038W 1890 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT7P40501 GEA2YEL022W 4380 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YMR160WYMR160W 2451 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YOR282WYOR282W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT7P40501 IES4YOR189W 351 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT7P40501 HMRA2YCR096C 360 nt0.67□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YPL044CYPL044C 549 nt0.67□□□□□ -2.3
AVT7P40501 VAR1Q0140 1197 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT7P40501 QCR9YGR183C 201 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YBR064WYBR064W 429 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT7P40501 YBR206WYBR206W 324 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT7P40501 RKR1YMR247C 4689 nt0.65□□□□□ -2.3
AVT7P40501 NHP2YDL208W 471 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT7P40501 CSN9YDR179C 489 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT7P40501 OLI1Q0130 231 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT7P40501 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT7P40501 PMP1YCR024C-A 123 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YAR053WYAR053W 297 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT7P40501 CMC4YMR194C-B 222 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YCK3YER123W 1575 nt0.63□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YDR344CYDR344C 444 nt0.63□□□□□ -2.31
AVT7P40501 NOP9YJL010C 2001 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT7P40501 SPO21YOL091W 1830 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT7P40501 PAA1YDR071C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT7P40501 BFR2YDR299W 1605 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT7P40501 PRP16YKR086W 3216 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YDR157WYDR157W 402 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YGR035CYGR035C 351 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YAR029WYAR029W 225 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT7P40501 BIL1YOR304C-A 231 nt0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.5 ms