Protein–RNA interactions for Protein: P38301

GDT1, GCR1-dependent translation factor 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDT1P38301 YHL042WYHL042W 453 nt0.95□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.95□□□□□ -2.26
GDT1P38301 GEA2YEL022W 4380 nt0.94□□□□□ -2.26
GDT1P38301 SMC1YFL008W 3678 nt0.94□□□□□ -2.26
GDT1P38301 RPL38YLR325C 237 nt0.94□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.94□□□□□ -2.26
GDT1P38301 LEE1YPL054W 906 nt0.94□□□□□ -2.26
GDT1P38301 PAU24YBR301W 363 nt0.94□□□□□ -2.26
GDT1P38301 NUP192YJL039C 5052 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YDR426CYDR426C 378 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 BSC3YLR465C 309 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YBR206WYBR206W 324 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 DOP1YDR141C 5097 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 CLU1YMR012W 3834 nt0.93□□□□□ -2.26
GDT1P38301 CSN9YDR179C 489 nt0.92□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YDR521WYDR521W 336 nt0.92□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YBR064WYBR064W 429 nt0.92□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YGR130CYGR130C 2451 nt0.92□□□□□ -2.26
GDT1P38301 MSH3YCR092C 3057 nt0.91□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.91□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.91□□□□□ -2.26
GDT1P38301 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.91□□□□□ -2.26
GDT1P38301 SPO75YLL005C 2607 nt0.9□□□□□ -2.26
GDT1P38301 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.9□□□□□ -2.27
GDT1P38301 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.9□□□□□ -2.27
GDT1P38301 ALG13YGL047W 609 nt0.89□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YOR053WYOR053W 342 nt0.89□□□□□ -2.27
GDT1P38301 BFR2YDR299W 1605 nt0.89□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YIR044CYIR044C 186 nt0.88□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.88□□□□□ -2.27
GDT1P38301 SEC1YDR164C 2175 nt0.88□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YLL007CYLL007C 1998 nt0.88□□□□□ -2.27
GDT1P38301 RIM20YOR275C 1986 nt0.88□□□□□ -2.27
GDT1P38301 CUL3YGR003W 2235 nt0.88□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YOR121CYOR121C 306 nt0.86□□□□□ -2.27
GDT1P38301 MCM10YIL150C 1716 nt0.85□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YDR344CYDR344C 444 nt0.84□□□□□ -2.27
GDT1P38301 ISD11YER048W-A 285 nt0.84□□□□□ -2.27
GDT1P38301 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.84□□□□□ -2.27
GDT1P38301 DBP6YNR038W 1890 nt0.84□□□□□ -2.28
GDT1P38301 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.83□□□□□ -2.28
GDT1P38301 YCK3YER123W 1575 nt0.83□□□□□ -2.28
GDT1P38301 PCC1YKR095W-A 267 nt0.82□□□□□ -2.28
GDT1P38301 IES4YOR189W 351 nt0.82□□□□□ -2.28
GDT1P38301 ASE1YOR058C 2658 nt0.82□□□□□ -2.28
GDT1P38301 NOP9YJL010C 2001 nt0.81□□□□□ -2.28
GDT1P38301 OLI1Q0130 231 nt0.81□□□□□ -2.28
GDT1P38301 VAR1Q0140 1197 nt0.81□□□□□ -2.28
GDT1P38301 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.81□□□□□ -2.28
GDT1P38301 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.81□□□□□ -2.28
GDT1P38301 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.81□□□□□ -2.28
GDT1P38301 YLR334CYLR334C 381 nt0.8□□□□□ -2.28
GDT1P38301 PTP2YOR208W 2253 nt0.79□□□□□ -2.28
GDT1P38301 PMP1YCR024C-A 123 nt0.79□□□□□ -2.28
GDT1P38301 ECM12YHR021W-A 456 nt0.79□□□□□ -2.28
GDT1P38301 LTE1YAL024C 4308 nt0.78□□□□□ -2.28
GDT1P38301 YAR053WYAR053W 297 nt0.78□□□□□ -2.28
GDT1P38301 RPL35AYDL191W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
GDT1P38301 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.76□□□□□ -2.29
GDT1P38301 YAR029WYAR029W 225 nt0.76□□□□□ -2.29
GDT1P38301 CMC4YMR194C-B 222 nt0.76□□□□□ -2.29
GDT1P38301 YOR282WYOR282W 321 nt0.76□□□□□ -2.29
GDT1P38301 NHP2YDL208W 471 nt0.75□□□□□ -2.29
GDT1P38301 YJL120WYJL120W 324 nt0.74□□□□□ -2.29
GDT1P38301 YPL044CYPL044C 549 nt0.74□□□□□ -2.29
GDT1P38301 CHS6YJL099W 2241 nt0.74□□□□□ -2.29
GDT1P38301 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.73□□□□□ -2.29
GDT1P38301 OST1YJL002C 1431 nt0.72□□□□□ -2.29
GDT1P38301 SPO21YOL091W 1830 nt0.71□□□□□ -2.3
GDT1P38301 IML1YJR138W 4755 nt0.71□□□□□ -2.3
GDT1P38301 RPS25BYLR333C 327 nt0.71□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YNL211CYNL211C 261 nt0.71□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.7□□□□□ -2.3
GDT1P38301 TAR1YLR154W-C 375 nt0.7□□□□□ -2.3
GDT1P38301 HTB2YBL002W 396 nt0.7□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YPL225WYPL225W 441 nt0.7□□□□□ -2.3
GDT1P38301 NPR2YEL062W 1848 nt0.7□□□□□ -2.3
GDT1P38301 HMRA2YCR096C 360 nt0.69□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
GDT1P38301 SSS1YDR086C 243 nt0.68□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YDR157WYDR157W 402 nt0.68□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YGR035CYGR035C 351 nt0.68□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
GDT1P38301 SGF11YPL047W 300 nt0.68□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.67□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.67□□□□□ -2.3
GDT1P38301 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
GDT1P38301 ANS1YHR126C 480 nt0.66□□□□□ -2.3
GDT1P38301 YML002WYML002W 2214 nt0.65□□□□□ -2.31
GDT1P38301 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
GDT1P38301 MYO1YHR023W 5787 nt0.63□□□□□ -2.31
GDT1P38301 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.63□□□□□ -2.31
GDT1P38301 YDR048CYDR048C 315 nt0.63□□□□□ -2.31
GDT1P38301 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.63□□□□□ -2.31
GDT1P38301 BIL1YOR304C-A 231 nt0.63□□□□□ -2.31
GDT1P38301 FYV10YIL097W 1551 nt0.62□□□□□ -2.31
GDT1P38301 PAA1YDR071C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
GDT1P38301 INA22YIR024C 651 nt0.62□□□□□ -2.31
GDT1P38301 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.5 ms